Книга Функция-3 Виталия Останина рассказывает о группе новусов — людей с особыми способностями, среди которых главный герой, Ликвидатор по прозвищу Иван. Он не является обычным человеком, а мутантом с уникальной силой находить и уничтожать подобных себе. Исходно герои оказываются в сложной ситуации во время Вторжения инопланетной расы, которая захватывает тела людей, создавая структуры подчинённых функций. В этот момент одна из таких структур, именуемая Структурой, вселяется в группу из десяти человек, полностью контролируя их тела и изменяя их на генетическом уровне, что обеспечивает им высокую регенерацию, силу и скорость. Иван и его товарищи сталкиваются с угрозой этих инопланетян, которые действуют как энергетические паразиты и обладают военным превосходством.

Развитие сюжета начинается с того, что Иван вместе с новообретёнными союзниками пытается выжить и собирать информацию о противнике. Параллельно он взаимодействует с функциями — искусственными интеллектами, работающими внутри захваченных тел, которые называются сегментами или узлами Структуры. Герой узнаёт о потерях своих товарищей, повреждённых мозгах и необходимости принимать решения в условиях неопределённости. Взаимодействие с этими функциями сопровождается трудностями из-за повреждений их носителей и отсутствия полноценного контроля. Лидеру приходится вести людей к заданной цели и сталкиваться с необходимостью децентрализации структуры управления, чтобы сохранить собственное существование и продолжать сопротивление....