Сюжет развивается через столкновения с влиянием этого проклятья. Герой и его спутники сталкиваются с неординарными игровыми механизмами, способными преобразовывать мир, например, сундуком с глиной и облаком удушающей пыли, героям приходится справляться с эффектом, который не снимается и сохраняется даже после смерти. В процессе герой приобретает опыт, изучает навыки, такие как Болотство, и готовится к предстоящему путешествию в Бездну, где ему потребуется максимальная сила и концентрация.

Главными проблемами противостояния становятся бессмертные игроки, которые ведут бесцельное существование и способны влиять на игровой процесс, а также посмертное проклятье мастера-гончара, изменяющее окружающий мир и усложняющее задачи героя. Конфликт строится вокруг необходимости понять и преодолеть загадки, связанные с глиняными созданиями и мастерством гончаров, а также загадкой пропавших тел и их связи с Виртуальным миром.

Для решения этих задач герой вынужден взаимодействовать с различными персонажами, включая дочь мастера Клэя, и использовать особые умения и заклинания. Он берет на себя роль исследователя и бойца, готовящегося к опасному походу в Бездну. В финальной части сюжет сосредоточен на попытках справиться с глиняным проклятьем, открыть новые игровые возможности и понять истинную природу загадок этого мира, что в итоге приводит к получению доступа к одному из ключевых порталов в игровом пространстве.

Таким образом, «Мертвый Инквизитор 3. Бездна Фанмира» отражает события, развивающиеся вокруг главного героя, который становится участником сложного взаимодействия с игровыми механиками, персонажами и загадками, сталкиваясь с вызовами, связанными с бессмертием, проклятиями и изменениями виртуального мира.