Книга Возвращение волхва: Против тысячи втроем Дмитрия Янковского рассказывает о событиях вокруг группы персонажей, среди которых главный герой Макс, обладающий военной подготовкой и участвующий в боевых операциях. В начале истории Макс вместе с соратниками оказывается в условиях конфликта между повстанцами и государственными силами. В их распоряжении появляются сведения о существовании древней магии и магических артефактах, что меняет восприятие происходящего. Сюжет развивается после смерти полковника Даниила Засекина, который был магом-инсургентом и обладал важным жезлом. Это событие открывает новые возможности и угрозы для героев. Основные конфликты связаны с опасностью использования магии в криминальных и политических целях, а также с противостоянием различных кланов и родов, в том числе клана Троекуровых.

В центре сюжета — попытка найти и получить доступ к «Книге всех заклинаний», спрятанной за окраиной Новгорода, чтобы освоить и использовать магические знания. Героям приходится обходить препятствия, проявлять осторожность и выбирать, кому можно доверять, особенно учитывая наличие врагов из числа инсургентов и магических соперников. Действия разворачиваются на фоне социального и политического напряжения в Российской Империи, где аристократические семьи пытаются сохранить свое влияние в меняющемся мире. Главный герой сталкивается с необходимостью не только защищать себя и свою команду, но и принимать решения, влияющие на судьбу магии и власти. Финальный акцент сюжета связан с подготовкой к добыче магической книги, которая может изменить соотношение сил, и с осознанием ограничений и рисков, связанных с магией и артефактами.