Алхимик должен умереть! Том 2 Валерия Юрича продолжает повествование о молодой алхимической империи, которую строит главный герой, Лис. Он — четырнадцатилетний сирота, оказавшийся на дне Никодимовской ямы, где каждая минута на счету. Несмотря на тяжелые условия и физические ограничения, он берет на себя ответственность за свою команду и постепенно приобретает ресурсы и поддержку, которые позволяют ему двигаться вперед. Его окружение составляют такие люди, как Мышь, Тим, Костыль и Кирпич, каждый из которых вносит свою долю в общую работу и разделяет с Лисом риск на опасной дороге становления.

Ситуация серьезна: главные герои работают в подполье и должны скрывать свои намерения и знания, чтобы избежать расправы. Общество и власть, противостоящие развитию алхимической деятельности, создают постоянное давление и угрозу. Лис сталкивается с необходимостью действовать быстро и решительно, чтобы выстроить лабораторию, наладить производство лекарств и укрепить связи с внешним миром, не вскрываясь. Важным моментом становится загадочная задача с потусторонним смыслом, которую Лис даёт новичкам в обучение, а ответ на неё оказывается связующим звеном с его близкими соратниками. Павел, один из них, скрывает тревожную тайну, и реакция его на шифр становится поворотным моментом в дальнейшем развитии событий....