Книга «Нетопырь» Вадима Чинцова сосредоточена на жизни главного героя Федора Петровича и его окружения в период сложных исторических событий. В начале повествования Федор Петрович еще курсант в военном училище, где впервые принимают женщин, среди которых его позже жена Светлана. События развиваются на фоне грядущих нашествий и политических интриг в Руси, разорванной на княжества. Главный герой вместе с друзьями и семьей оказывается вовлечен в борьбу за объединение страны и защиту от внешних угроз. После смерти ряда князей Петрович получает новое положение, ведет работу по формированию службы безопасности и организации молодых людей в защитные структуры.

Одновременно идет подготовка к походу на Чернигов, где планируется проникновение под видом купеческого каравана с целью захвата города и устранения противников. Главные конфликты связаны с борьбой за власть среди князей, попытками объединить русские земли против внешних врагов, а также внутренними разногласиями и предательствами. Герою и его дружине приходится принимать решения, связанные с ведением скрытых операций, вербовкой агентов и воспитанием молодых воинов, чтобы подготовить их к будущим сложным военным действиям. Сюжетная линия приводит к концентрации сил для наступательной операции на Чернигов с учетом влияния неожиданности и применения хитрости, а также предусматривает жесткие меры по устранению возможных врагов внутри. В финале история фокусируется на укреплении позиций главного героя и его приближенных, а также на планах по дальнейшему объединению земств и борьбе с врагами, что отражает выработку стратегии выживания и усиления власти в условиях раздираемого конфликтами государства.