Основные проблемы связаны с тяжелым выбором стратегии: рискнуть вступить в бой с меньшими силами и новым оружием, или пытаться держать оборону, учитывая, что любые ошибки могут привести к полной гибели гарнизона. Кроме того, сложно скрыть перестановки внутри отряда, так как в городе присутствует много сторонников Кучума и шпионов. Конфликт обостряется из-за внутренней напряжённости, например, недоверия к заместителю Ермака и управленческим решениям, а также из-за недостатка ресурсов и оружия, которые лишь частично можно компенсировать собственной смекалкой и разработками.

Героям приходится принимать сложные решения по размещению сил, подготовке обороны и использованию ограниченных средств для максимального эффекта. Особое внимание уделяется роли инженера и изобретателя в отряде, который пытается создать эффективное оружие и организовать самострелы для повышения боеспособности. Среди них есть и другие ключевые участники – старший стрелец Андрей Собакин и плотник Дементий Лапоть, который участвует в строительстве защитных сооружений и испытании новых видов оружия.

В финале сюжетного фокуса книга концентрируется на предстоящем решающем бою, в котором многое зависит от применения новых методов и техники, а также от правильной организации обороны и моральной устойчивости бойцов. Размышления главного героя отражают тяжелые обстоятельства и необходимость принимать рискованные решения, осознавая, что в случае неудачи последствия будут фатальны для всей команды и достижения их целей в Сибири.