«Злой гений» Порт-Артура авторства Германа Романова сосредоточен на персонаже по имени Фок, генерале русской армии, который оказывается в сложной ситуации в период русско-японской войны. В начале повествования он находится в обстановке обороны Порт-Артура, крепости, где происходят военные действия между русскими и японцами. Развитие сюжета начинает происходить с того момента, когда обычные представления о ходе войны начинают меняться, и Фок осознаёт, что привычные знания и опыт могут оказаться недостаточными. Он оказывается вовлечён в стратегические и тактические решения, которые оказывают влияние на судьбу крепости и её защитников. Сопровождая военные операции, персонажи сталкиваются с проблемами командования, конфликтами вокруг ответственности за действия и решения, а также с последствиями боёв, включая потери и трофеи.

Фок приходится принимать решения, которые вызывают неоднозначную реакцию среди других командиров и политиков, что создаёт внутренние противоречия и напряжённость в руководстве. Помимо военных событий, в книге отражено также влияние сна и озарений героя на события, а сам Фок представлен как человек, который через свои действия способен изменить ход войны. В финале сюжет сосредоточен на том, как эти изменения влияют на командование и оборону Порт-Артура, демонстрируя трудности и сложность принятия решений в условиях войны. Война предстает не только как внешний конфликт, но и как процесс, затрагивающий личные и профессиональные испытания героев, в первую очередь генерала Фока.