Роман «Доктор Фауст и его агентура» написан Марком Зиновьевичем Берколайко и относится к современной прозе. Главным героем произведения является Наум Наумович, получивший прозвище Доктор Фауст, человек, погружённый в размышления о науке, управлении и смыслах жизни. Его образ строится на фоне личных и профессиональных испытаний, связанных с поиском новых подходов к пониманию сложных процессов, происходящих в мире и обществе. Вместе с ним в повествовании появляются четыре молодых человека, каждый из которых связан с доктором Фаустом и представляет разные стороны живого взаимодействия между поколениями и идеями.

Исходная ситуация показывает Наума Наумовича как одинокого учёного, который тщательно организует свой распорядок дня и жизнь ради достижения больших целей. Его внутренний мир насыщен мыслями о науке, упадке прежних устоев и необходимости перемен. Он ведёт диалоги с молодыми людьми, в том числе с Сергеем, прозванным Троцким, который выбирает иной путь, предпочитая строительство собственного дела, а не продолжение научных исследований. Эти взаимодействия и разногласия отражают основную проблему: противостояние между старым и новым, между мечтой о великих свершениях и реальностью, в которой научная деятельность всё чаще уступает место бизнесу и прагматизму....