Главными участниками событий помимо Джекила и Хайда выступают мистер Аттерсон, нотариус и друг Джекила, и его слуга Пул. Аттерсон начинает подозревать неладное после серии странных происшествий, связанных с Хайдом, и пытается разобраться в причинах. В процессе расследования он сталкивается с таинственными документами, завещаниями и записками, которые оставляет доктор. Протекание сюжета связано с раскрытием тайны двойной личности, а также с растущей тревогой за судьбу Джекила, которому всё сложнее противостоять своей тёмной стороне.

В развитии сюжета обостряются внутренние и внешние противоречия. На одной стороне выступает Джекил — человек с устоявшимися моральными принципами и социальным положением, на другой — Хайд с его насильственным и злобным поведением. Возможно, самым серьёзным обстоятельством становится осознание Джекила того, что он может окончательно потерять управление своим изменённым "я" и навсегда остаться в роли Хайда. Это создаёт угрозу нравственной и физической катастрофы. Конфликт приводит героя к необходимости сделать выбор между двумя существующими в нём натурами. В конечном итоге сюжет фокусируется на том, что Джекил теряет контроль над экспериментом и его двойственность становится неразрешимой проблемой.