Начало событий связано с попытками внешних врагов — велатов Свиры, местных сектантов, — вмешаться в планы Ордена. Они пытаются навредить, устраивая нападения и используя шпионов для сбора данных о потенциальных кандидатов. Шейн становится жертвой одной из таких атак, но при помощи Листьев Ветви, близких союзников в Ордене, остаётся в безопасности. После этого герой начинает активное участие в процессе трансформации, научных экспериментах и постепенно осваивает своё новое место в системе Мирового Древа. Он обретает ощущение принадлежащего к большой сети единомышленников и защитников, которые духовно, ментально и энергетически связаны между собой, что становится ключевым элементом его существования.

Главный конфликт разворачивается как внутреннее и внешнее противостояние: Шейн должен принять изменения в себе и своей жизни, что требует полной перестройки организма и сознания, одновременно сохраняя контакт с внешним миром. В этом контексте раскрываются темы ответственности перед Орденом и Императором, поиск поддержки среди новых союзников и фиксация происходящих изменений в научных данных. Сюжет держится на вопросе интеграции человека в сложную многоуровневую структуру, которая становится основой для новой жизни и защищённого положения героя. В конечном итоге Шейн приобретает новый уровень осознания, связи и поддержки, что снимает чувство одиночества и задаёт вектор его дальнейшего пути в рамках Империи и Ордена.