Ученик мракоборца. Книга 3. Корень зла Кирилла Смородина сосредотачивается на главном герое Страде и его наставнике мракоборце Дролле. Страд находится в ситуации, когда им предстоит опасное путешествие к острову Ламирэльи, чтобы найти способ избавиться от Червоточины — зловещего облака черного дыма, из которого появляются чудовища и которое несет разрушения. Это путешествие вызвано желанием Страда положить конец этой угрозе, что связано с его личной мотивацией и потерей родителей. В начале сюжета Страд выражает стремление сопровождать группу мракоборцев и мастера Дролла, несмотря на то, что он лишь полумаг и сомневается в своей полезности. Дролл предупреждает его о возможной длительности и опасности пути, не исключая, что он может стать путем в один конец.

Главные события развиваются вокруг их подготовки, перехода в опасную зону и участия в тренировках по искусству боя, в которых Дролл выступает инструктором. Помимо внешних угроз, сюжет затрагивает внутренние конфликты и отношения между персонажами. На фоне путешествия возникают напряжения между другими учениками, такими как Венкролл и Сункворр, чьи взаимоотношения осложнены взаимной неприязнью и сложностями, связанными с их природой и возможными отклонениями от нормы, что поднимается в беседе наставников и старейшин. Внутренние сомнения и страхи, а также загадочные сны Дролла, сопровождающие его на протяжении ночей перед отправлением, служат показателем сложностей, с которыми героям придется столкнуться. Сюжет фокусируется на борьбе с Червоточиной и борьбе с внутренними трудностями, на необходимости объединения и преодоления личных и коллективных проблем. История строится вокруг сознательного выбора героев идти навстречу опасностям ради большого дела и надежды на избавление от зла, несмотря на непредсказуемость и возможные жертвы.